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尋找“獨角獸”丨百奧幾何:以科學智能實現蛋白質“設計自由”
2025-05-28 記者 吳蔚 來源:經濟參考報

  當人工智能“遇見”生物制造,兩大前沿技術將“碰撞”出怎樣的火花?在北京百奧幾何生物科技有限公司,記者得到了這個問題的答案:通過人工智能在科學領域的應用(AI for Science,科學智能),讓從頭“設計”蛋白質成為可能。在業界看來,這一顛覆性技術創新將打開萬億級的市場,由此也有望誕生千億市值的企業,百奧幾何的未來可期。

  從0到1的技術創新

  走進百奧幾何位于北京中關村的研發中心,桌面上一個蛋白質分子三維模型分外醒目。百奧幾何創始人唐建向記者介紹,與大語言模型不同,由于蛋白質不僅是一個序列,而且是三維結構,而結構決定功能,因此蛋白質大模型也更加復雜。

  百奧幾何不久前正式發布了全球首個全場景原子級蛋白質大模型GeoFlow V2,該模型首次以原子級精度統一蛋白質結構預測與從頭設計兩大核心能力,為生命大分子提供了從理解到創造的一站式解決方案,可廣泛應用于包括生物醫藥、食品、化工、醫美、材料等整個生物制造領域。

  “這將為工業級蛋白質設計應用帶來更多從0到1的突破?!碧平ū硎?,過去科學家只能去發現自然界中的蛋白質,或是在實驗室中通過大量試驗合成蛋白質,如今利用人工智能從海量數據學習挖掘和建模復雜規律的優勢,就可以預測甚至設計全新蛋白質結構。

  這樣的技術突破并非僅僅停留在理論層面,而是已經得到了實驗驗證。記者了解到,在一項復雜的功能蛋白質替代設計任務中,GeoFlow V2僅一輪生成即可獲得高性能專利級分子。相較于過去依賴5輪文庫構建與實驗迭代才能有概率篩出的分子,GeoFlow V2實現一步到位的定向生成,直達性能峰值,在顯著縮短研發周期的同時實現性能和知識產權的雙重突破。

  在另一項針對某高價值非天然氨基酸的研發任務中,GeoFlow V2首次挖掘并從頭設計出一款能夠催化全新反應類型的酶種,并通過兩輪AI驅動的酶定向進化將其催化活性提升65倍,構建出一條原料價格低廉、轉化率高、路徑更短的一步體外酶法合成路線,全流程僅用兩個月完成。

  “這不只是模型能力的躍升,更實現了‘生命分子的可編程性’向工程化與商業化可用性的大規模轉變?!碧平ㄍ嘎?,百奧幾何已經打通了從設計、驗證到落地的全鏈路生物制造閉環,可以實現真正意義上的“智能創制”。目前,百奧幾何已與多家國內外企業達成授權合作,多個自研產品已達到生產落地水平。

  從生物醫藥到生物制造的應用拓展

  盡管百奧幾何正式運營不到三年,但是在人工智能賦能生物制造領域已經是頭部企業。其核心團隊是生成式AI在分子生成領域的開拓者,早在2021年就將擴散模型用于分子的三維結構生成,其關鍵論文是2022年AI領域引用量排名前50的論文之一。

  作為AI制藥領域頂級科學家,唐建已獲得業界享有盛名的Mila實驗室(加拿大魁北克省人工智能研究中心)終身教職。2022年底,唐建帶領團隊回國創立百奧幾何,并邀請到深度學習三巨頭之一、AI之父、圖靈獎獲得者約書亞·本吉奧擔任公司首席科學顧問。

  “創業的過程并非一帆風順?!碧平ǜ嬖V記者,剛開始公司的研發方向主要是生物醫藥抗體藥物,但是抗體藥物落地周期長、投入成本高。在不斷試錯、不斷探索中,唐建發現生物制造領域蛋白質有很大的機會(如生物催化酶分子的設計),于是果斷決定拓展蛋白質設計在生物制造領域的應用。

  生物制造的核心挑戰在于發現高附加值分子(如抗體、疫苗、多肽類分子)或是優化已有的微生物菌株和生物催化酶分子,以提高生產效率并降低成本。因此,如何快速并準確發現具有高活性的蛋白質大分子就成為生物制造多個領域的關鍵。百奧幾何的技術優勢在這一新賽道上很快如魚得水。而唐建看到的優勢還不僅于此。

  “首先,國內超大規模市場優勢給生物制造帶來很大機遇,從醫藥到美妝,從食品到化工,對抗體、酶等各種蛋白質的需求非常大,應用場景豐富;其次,國內的產業鏈、供應鏈優勢,使生物制造從設計到實驗室再到產線的過程大大縮短,研發落地速度快。此外,還有成熟的制造業帶來的數據優勢、工程師紅利帶來的人才優勢等,加上國內的產業政策優勢,讓百奧幾何集齊了天時、地利、人和?!碧平ㄕf,在當地政府的支持下,百奧幾何已經在北京、上海建成了高通量蛋白質實驗室,并將在深圳等地合作建廠,加速自有產品落地。

  從中國到世界的成長路徑

  “我們未來的一個重點是走向國際化?!碧平ǘ啻螐娬{,未來一定是中國研發、全球生產,這也是未來產業發展的一個大趨勢。

  百奧幾何還有一個長期愿景是加速中國制造實現數字化、智能化、綠色化、可持續發展轉型。

  作為全球新一輪科技革命和產業變革的重要組成部分,生物制造正從根本上變革傳統的生產方式,吸引世界各國紛紛布局。與傳統制造業依賴石油為基礎的化學合成帶來環境污染和高昂成本有所不同,生物制造采用微生物和生物催化技術,以玉米、秸稈等可再生生物質為原料進行產品合成,其效率、環保性和可持續性優勢明顯。據預測,未來將有超過60%的產品采用生物制造方法生產,其市場價值有望飆升至30萬億美元,甚至超過數字經濟的市場規模。技術突破與政策利好頻頻出現,生物制造賽道已處在爆發前夜。

  “萬億級的市場一定會誕生千億市值的企業?!碧平ㄐ坌牟?。

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